mcp-simple-pubmed

Name: mcp-simple-pubmed
Availability: InStock
Author: Andy Brandt

MCP Simple PubMedは、Entrez APIを通じてPubMed記事にアクセスするためのサーバーです。キーワード検索、記事の要約の取得、オープンアクセス記事のフルテキストのダウンロードが可能です。AI向けにXML形式で情報を提供し、文書構造についての追加情報を含んでいます。

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イシュー

インストール方法

難易度

中級

推定所要時間

10-20 分

必要な環境

Python 3.6以上

インストール方法

前提条件

必要なソフトウェアとバージョンを明記してください。

Python: 3.6以上

インストール手順

1. リポジトリのクローン

bash
git clone https://github.com/andybrandt/mcp-simple-pubmed.git
cd mcp-simple-pubmed

2. 依存関係のインストール

bash
pip install mcp-simple-pubmed

トラブルシューティング

よくある問題

問題: サーバーが起動しない 解決策: Pythonのバージョンを確認し、依存関係を再インストールしてください。問題: APIキーが無効 解決策: NCBIのウェブサイトでAPIキーを再確認してください。

設定方法

基本設定

環境変数

以下の環境変数を設定する必要があります：

bash
export PUBMED_EMAIL="your-email@example.com"
export PUBMED_API_KEY="your-api-key"  # 任意

設定例

基本的な設定

json
{
  "mcpServers": {
    "simple-pubmed": {
      "command": "python",
      "args": ["-m", "mcp_simple_pubmed"],
      "env": {
        "PUBMED_EMAIL": "your-email@example.com"
      }
    }
  }
}

使用例

基本的な使用方法

プログラムでの使用

python
import requests

def call_pubmed_tool(tool_name, params):
    response = requests.post(
        'http://localhost:3000/mcp/call',
        json={
            'tool': tool_name,
            'parameters': params
        }
    )
    return response.json()

使用例
result = call_pubmed_tool('search', {
    'query': 'COVID-19',
    'options': {'format': 'json'}
})
print(result)